A investigação no CIEd está estruturada em Linhas de Investigação e respectivos Projectos Colectivos e Projectos Individuais. As linhas de investigação concretizam a política do Instituto de Educação e Psicologia segundo grandes áreas do conhecimento e da produção científica, através de objectivos de longo prazo que presidem à organização e à execução dos projectos de investigação neles inscritos.