Os Departamentos são organizações permanentes de criação e transmissão do conhecimento no domínio de uma disciplina ou grupo de disciplinas, constituindo, como tal, a célula-base de organização científico-pedagógica e de gestão de recursos humanos e materiais num dado domínio do saber.
Os departamentos gozam de autonomia científica, pedagógica e administrativa no quadro da política definida pelo Conselho do Instituto.
São 3 os departamentos do Instituto de Estudos da Criança: