Em 18 de Março de 2008 foi publicado um estudo comparativo Deloitte/FCT de sistemas governamentais de atribuição de bolsas de doutoramento e pós-doutoramento em diversos países incluindo Portugal.
A FCT fornece informações sobre programas europeus no âmbito do 7º Programa Quadro como as Acções Marie Curie.
Na sequência do Compromisso com a Ciência assumido pelo XVII Governo, a FCT tem vindo a realizar acções com o objectivo de promover a inserção profissional de doutorados.
A FCT financia uma extensa lista de diferentes tipos de Bolsas na sua maioria para preparação de doutoramento ou a nível pós-doutoral e atribuídas através de um Concurso Individual de Bolsas de periodicidade anual.
A FCT financia e avalia Unidades de I&D de áreas científicas extremamamente variadas e, em particular, Laboratórios Associados.
O concurso de projectos em todos os domínios científicos mais recente esteve aberto em 2006 estando ainda a decorrer a sua avaliação.
O Programa Nacional de Re-equipamento Científico foi criado para apoiar financeiramente a aquisição, actualização e expansão de equipamentos científicos e a constituição de Redes Nacionais de equipamentos de grande dimensão.
O FACC apoia selectivamente iniciativas da comunidade científica que contemplem a promoção de actividades de I&D ou de transmissão de conhecimentos em qualquer área científica e que não possam ser apoiadas através de programas específicos da FCT.
A FCT é um membro de várias redes científicas e de política científica dedicadas à cooperação transnacional:
O análogo a nível da União Europeia da FCT é o ERC.
Uma das missões da FCT consiste em apoiar a criação de parcerias internacionais entre entidades científicas e universitárias portuguesas e congéneres líderes a nível mundial.
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A FCT apoia o desenvolvimento da plataforma DeGóis que oferece funcionalidades mais avançadas que as actualmente disponíveis no FCTSIG para o registo de currículos.